O projecto original pertencia ao engenheiro militar Carlos da Cruz Amarante.
Contudo, ainda na fase de execução, foi modificado pelo arquitecto João Francisco Guimarães, irmão trinitário, que por sua vez foi substituído durante as obras pelo professor de arquitectura José Geraldo da Silva Godinho. Do projecto original manteve-se o gosto neoclássico.
O templo pertencia à Ordem Trinitária que substituíra a Ordem Terceira de S. Domingos, extinta em 1755.
Estabeleceu-se no início do século XIX no Laranjal, como na altura era conhecida a actual zona da Trindade.